В канун пятой годовщины трагедии 2014 года в заливе Сан-Франциско, где гигантский ящер Годзилла в битве с экспериментальными ГННУСами унёс жизни тысяч невинных, мир всё ещё залечивает раны. Родственники жертв собираются у мемориала, требуя от правительства разоблачить секретную коалицию «Монарх» – виновников экологической катастрофы, уничтоживших океанических чудовищ в безуспешных поисках исчезнувшего титана. Среди скорбящих – Мэдисон Рассел, 18-летняя студентка, чей младший брат погиб в той бойне, разрушившей её семью. Родители развелись, мать Эмма, ведущий учёный, борется с прошлым, тестируя «Орку» – мощное устройство акустического контроля гигантов.
На юге Китая, в тайной базе, женщина проводит эксперимент: из древнего кокона пробуждается величественная Мотра, бабочка-титан. Но техника даёт сбой, и на объект нападают эко-террористы во главе с бывшим военным Аланом Джоной, фанатиком, видящим в монстрах угрозу человечеству. Они захватывают Эмму и случайно прибывшую дочь, намереваясь использовать «Орку» для глобального хаоса. Получив письмо от отца Марка, Мэдисон узнаёт, что он жив и готов действовать. Вспоминая навыки, он разоблачает заговор Джоны: террорист планирует спровоцировать войну монстров, чтобы «очистить» Землю. Но успех приходит лишь с помощью Годзиллы – древнего стража, пробудившегося из глубин.
